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Defective excitation-contraction coupling and mitochondrial respiration precede mitochondrial Ca2+ accumulation in spinobulbar muscular atrophy skeletal muscle
2023 Marchioretti, Caterina; Zanetti, Giulia; Pirazzini, Marco; Gherardi, Gaia; Nogara, Leonardo; Andreotti, Roberta; Martini, Paolo; Marcucci, Lorenzo; Canato, Marta; R Nath, Samir; Zuccaro, Emanuela; Chivet, Mathilde; Mammucari, Cristina; Pacifici, Marco; Raffaello, Anna; Rizzuto, Rosario; Mattarei, Andrea; Desbats, MARIA ANDREA; Salviati, Leonardo; Megighian, Aram; Sorarù, Gianni; Pegoraro, Elena; Belluzzi, Elisa; Pozzuoli, Assunta; Biz, Carlo; Ruggieri, Pietro; Romualdi, Chiara; P Lieberman, Andrew; J Babu, Gopal; Sandri, Marco; Blaauw, Bert; Basso, Manuela; Pennuto, Maria
Integrated Transcriptome Analysis of Human Visceral Adipocytes Unravels Dysregulated microRNA-Long Non-coding RNA-mRNA Networks in Obesity and Colorectal Cancer
2020 Tait, S.; Baldassarre, A.; Masotti, A.; Calura, E.; Martini, P.; Vari, R.; Scazzocchio, B.; Gessani, S.; Del Corno, M.
MOSClip: multi-omic and survival pathway analysis for the identification of survival associated gene and modules
2019 Martini, P.; Chiogna, M.; Calura, E.; Romualdi, C.
Transcriptome Profiles of Human Visceral Adipocytes in Obesity and Colorectal Cancer Unravel the Effects of Body Mass Index and Polyunsaturated Fatty Acids on Genes and Biological Processes Related to Tumorigenesis
2019 Del Cornò, Manuela; Baldassarre, Antonella; Calura, Enrica; Conti, Lucia; Martini, Paolo; Romualdi, Chiara; Varì, Rosaria; Scazzocchio, Beatrice; D'Archivio, Massimo; Masotti, Andrea; Gessani, Sandra
Single cell analysis reveals the involvement of the long non-coding RNA Pvt1 in the modulation of muscle atrophy and mitochondrial network
2019 Alessio, Enrico; Buson, Lisa; Chemello, Francesco; Peggion, Caterina; Grespi, Francesca; Martini, Paolo; Massimino, Maria L; Pacchioni, Beniamina; Millino, Caterina; Romualdi, Chiara; Bertoli, Alessandro; Scorrano, Luca; Lanfranchi, Gerolamo; Cagnin, Stefano
Multisite analysis of high-grade serous epithelial ovarian cancers identifies genomic regions of focal and recurrent copy number variation in 3p26.2 and 8q24.3
2019 Ballabio, Sara; Craparotta, Ilaria; Paracchini, Lara; Mannarino, Laura; Corso, Silvia; Pezzotta, Maria Grazia; Vescio, Martina; Fruscio, Robert; Romualdi, Chiara; Dainese, Emanuele; Ceppi, Lorenzo; Calura, Enrica; Pileggi, Silvana; Siravegna, Giulia; Pattini, Linda; Martini, Paolo; Delle Marchette, Martina; Mangioni, Costantino; Ardizzoia, Antonio; Pellegrino, Antonio; Landoni, Fabio; D'Incalci, Maurizio; Beltrame, Luca; Marchini, Sergio
Transcriptional Characterization of Stage I Epithelial Ovarian Cancer: A Multicentric Study
2019 Calura, Enrica; Ciciani, Matteo; Sambugaro, Andrea; Paracchini, Lara; Benvenuto, Giuseppe; Milite, Salvatore; Martini, Paolo; Beltrame, Luca; Zane, Flaminia; Fruscio, Robert; Marchette, Martina Delle; Borella, Fulvio; Tognon, Germana; Ravaggi, Antonella; Katsaros, Dionyssios; Bignotti, Eliana; Odicino, Franco; D'Incalci, Maurizio; Marchini, Sergio; Romualdi, Chiara
NELL1, whose high expression correlates with negative outcomes, has different methylation patterns in alveolar and embryonal rhabdomyosarcoma
2017 Tombolan, Lucia; Poli, Elena; Martini, Paolo; Zin, Angelica; Romualdi, Chiara; Bisogno, Gianni; Lanfranchi, Gerolamo
KrillDB: A de novo transcriptome database for the Antarctic krill (Euphausia superba)
2017 Sales, Gabriele; Deagle, Bruce E.; Calura, Enrica; Martini, Paolo; Biscontin, Alberto; DE PITTA', Cristiano; Kawaguchi, So; Romualdi, Chiara; Meyer, Bettina; Costa, Rodolfo; Jarman, Simon
Circulating miRNA landscape identifies miR-1246 as promising diagnostic biomarker in high-grade serous ovarian carcinoma: A validation across two independent cohorts
2017 Todeschini, Paola; Salviato, Elisa; Paracchini, Lara; Ferracin, Manuela; Petrillo, Marco; Zanotti, Laura; Tognon, Germana; Gambino, Angela; Calura, Enrica; Caratti, Giulia; Martini, Paolo; Beltrame, Luca; Maragoni, Lorenzo; Gallo, Daniela; Odicino, Franco E.; Sartori, Enrico; Scambia, Giovanni; Negrini, Massimo; Ravaggi, Antonella; D'Incalci, Maurizio; Marchini, Sergio; Bignotti, Eliana; Romualdi, Chiara
A prognostic regulatory pathway in stage I epithelial ovarian cancer: New hints for the poor prognosis assessment
2016 Calura, Enrica; Paracchini, L.; Fruscio, R.; Difeo, A.; Ravaggi, A.; Peronne, J.; Martini, Paolo; Sales, Gabriele; Beltrame, L.; Bignotti, E.; Tognon, G.; Milani, R.; Clivio, L.; Dell'Anna, T.; Cattoretti, G.; Katsaros, D.; Sartori, E.; Mangioni, C.; Ardighieri, L.; D'Incalci, Maurizio; Marchini, S.; Romualdi, Chiara
Global DNA methylation profiling uncovers distinct methylation patterns of protocadherin alpha4 in metastatic and non-metastatic rhabdomyosarcoma
2016 Tombolan, Lucia; Poli, Elena; Martini, Paolo; Zin, Angelica; Millino, Caterina; Pacchioni, Beniamina; Celegato, Barbara; Bisogno, Gianni; Romualdi, Chiara; Rosolen, Angelo; Lanfranchi, Gerolamo
Pyrosequencing andde novoassembly of Antarctic krill (Euphausia superba)transcriptome to study the adaptability of krill to climate-induced environmental changes
2015 Meyer, B.; Martini, Paolo; Biscontin, A.; DE PITTA', Cristiano; Romualdi, Chiara; Teschke, M.; Frickenhaus, S.; Harms, L.; Freier, U.; Jarman, S.; Kawaguchi, S.
Measuring the loss of duplicated genes in plant genomes assembled by means of short reads.
2015 DE PASCALE, Fabio; Martini, Paolo; Vezzi, Alessandro
Profiling cancer gene mutations in longitudinal epithelial ovarian cancer biopsies by targeted next-generation sequencing: A retrospective study
2015 Beltrame, L; Di Marino, M.; Fruscio, R.; Calura, Enrica; Chapman, B.; Clivio, L.; Sina, F.; Mele, C.; Iatropoulos, P.; Grassi, T.; Fotia, V.; Romualdi, Chiara; Martini, Paolo; Noris, M.; Paracchini, L.; Craparotta, I.; Petrillo, M.; Milani, R.; Perego, P.; Ravaggi, A.; Zambelli, A.; Ronchetti, E.; D'Incalci, Maurizio; Marchini, S.
454 pyrosequencing and de novo assembly of Antarctic krill (Euphausia superba)transcriptome
2014 Biscontin, Alberto; Martini, Paolo; DE PITTA', Cristiano; Romualdi, Chiara; Teschke, M.; Frickenhaus, S.; Harms, L.; Freier, U.; Spahic, S.; Jarman, S.; Kawaguchi, S.; Costa, Rodolfo; Meyer, B.
Wiring miRNAs to pathways: a topological approach to integrate miRNA and mRNA expression profiles.
2014 Calura, Enrica; Martini, Paolo; Sales, Gabriele; Beltrame, L; Chiorino, G; D'Incalci, M; Marchini, S; Romualdi, Chiara
timeClip: pathway analysis for time course data without replicates
2014 Martini, Paolo; Sales, Gabriele; Calura, Enrica; Cagnin, Stefano; Chiogna, Monica; Romualdi, Chiara
Altered gene transcription in human cells treated with Ludox® silica nanoparticles.
2014 Fede, Caterina; Millino, Caterina; Pacchioni, Beniamina; Celegato, Barbara; Compagnin, Chiara; Martini, Paolo; Selvestrel, Francesco; Mancin, Fabrizio; Celotti, Lucia; Lanfranchi, Gerolamo; Mognato, Maddalena; Cagnin, Stefano
Tissue-specific expression and regulatory networks of pig microRNAome.
2014 Martini, Paolo; Sales, Gabriele; Brugiolo, M; Gandaglia, A; Naso, F; DE PITTA', Cristiano; Spina, Michele; Gerosa, Gino; Chemello, Francesco; Romualdi, Chiara; Cagnin, Stefano; Lanfranchi, Gerolamo
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