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Characterization of Gut Microbiome Composition in Patients with Triple-Negative Breast Cancer Treated with Neoadjuvant Chemotherapy
2023 Vernaci, Grazia; Savarino, EDOARDO VINCENZO; Patuzzi, Ilaria; Facchin, Sonia; Zingone, Fabiana; 1, Davide Massa; Faggioni, Giovanni; Giarratano, Tommaso; Miglietta, Federica; Griguolo, Gaia; Fassan, Matteo; Lo Mele, Marcello; Gasparini, Elisa; Bisagni, Giancarlo; Guarneri, Valentina; Dieci, MARIA VITTORIA
Machine Learning and Canine Chronic Enteropathies: A New Approach to Investigate FMT Effects
2022 Innocente, Giada; Patuzzi, Ilaria; Furlanello, Tommaso; Di Camillo, Barbara; Bargelloni, Luca; Giron, Maria Cecilia; Facchin, Sonia; Savarino, Edoardo; Azzolin, Mirko; Simionati, Barbara
A specific microbiota signature is associated to various degrees of ulcerative colitis as assessed by a machine learning approach
2022 Barberio, B.; Facchin, S.; Patuzzi, I.; Ford, A. C.; Massimi, D.; Valle, G.; Sattin, E.; Simionati, B.; Bertazzo, E.; Zingone, F.; Savarino, E. V.
Beware to ignore the rare: how imputing zero-values can improve the quality of 16S rRNA gene studies results
2022 Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; Di Camillo, Barbara
Characterization of intestinal microbiota in normal weight and overweight Border Collie and Labrador Retriever dogs
2022 Morelli, Giada; Patuzzi, Ilaria; Losasso, Carmen; Ricci, Antonia; Contiero, Barbara; Andrighetto, Igino; Ricci, Rebecca
Case report faecal microbiome transplantation as a solution to chronic enteropathies in dogs: A case study of beneficial microbial evolution
2021 Berlanda, M.; Innocente, G.; Simionati, B.; Di Camillo, B.; Facchin, S.; Giron, M. C.; Savarino, E.; Sebastiani, F.; Fiorio, F.; Patuzzi, I.
Modeling Microbial Community Networks: Methods and Tools
2021 Cappellato, Marco; Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; DI CAMILLO, Barbara
Effect of sterilization on the canine vagina microbiota: a pilot study
2020 Rota, Ada; Corrò, Michela; Patuzzi, Ilaria; Milani, Chiara; Masia, Stefania; Mastrorilli, Eleonora; Petrin, Sara; DEL LONGO, Alessandra; Del Carro, Angela; Losasso, Carmen
Zero-imputation in 16S rRNA gene studies: do we need it?
2020 Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; DI CAMILLO, Barbara
metaSPARSim: a 16S rRNA gene sequencing count data simulator
2019 Patuzzi, Ilaria; Baruzzo, Giacomo; Losasso, Carmen; Ricci, Antonia; Di Camillo, Barbara
Evaluation and quantification of antimicrobial residues and antimicrobial resistance genes in two Italian swine farms
2019 Petrin, S.; Patuzzi, I.; Di Cesare, A.; Tiengo, A.; Sette, G.; Biancotto, G.; DAL CORNO, GIAN FERRUCCIO; Drigo, M.; Losasso, C.; Cibin, V.
SPARSim single cell: a count data simulator for scRNA-seq data
2019 Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; Di Camillo, Barbara
Vaginal Microbiota of healthy anestrus bitches: culture vs. geomic analysis results
2019 Corrò, M; Milani, C; Patuzzi, I; Mastrorilli, E; Petrin, S; Longo, A; Previati, A; Del Carro, A; Masia, S; Losasso, C; Rota, A.
SPARSim Single Cell: a count data simulator for single cell RNA-seq data
2019 Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; DI CAMILLO, Barbara
Reliable simulation of count data for single cell RNA sequencing
2019 Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; DI CAMILLO, Barbara
SPARSim Single Cell: a count data simulator for single cell RNA-seq data
2019 Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; DI CAMILLO, Barbara
EAR MICROBIOTA IN HEALTHY DOGS
2019 Berlanda, Michele; Corrò, Michela; Zuliani, Federica; Berto, Laura; Patuzzi, Ilaria; Mastrorilli, Eleonora; Petrin, Sara; DEL LONGO, Alessandra; Losasso, Carmen; Masia, Stefania; Guglielmini, Carlo; Poser, Helen
Characterization of intestinal microbiome in overweight and non-overweight dogs of different breeds
2019 Morelli, Giada; Losasso, Carmen; Patuzzi, Ilaria; Ricci, Antonia; Andrighetto, Igino; Ricci, Rebecca
16S rRNA gene sequencing sparse count matrices: a count data simulator and optimal pre-processing pipelines
2018 Patuzzi, Ilaria
Assessing antimicrobial resistance gene load in vegan, vegetarian and omnivore human gut microbiota
2018 Losasso, Carmen; Di Cesare, Andrea; Mastrorilli, Eleonora; Patuzzi, Ilaria; Cibin, Veronica; Eckert, Ester M.; Fontaneto, Diego; Vanzo, Angiola; Ricci, Antonia; Corno, Gianluca
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