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benchdamic: benchmarking of differential abundance methods for microbiome data
2023 Calgaro, Matteo; Romualdi, Chiara; Risso, Davide; Vitulo, Nicola
CK2β-regulated signaling controls B cell differentiation and function
2023 Quotti Tubi, L.; Mandato, E.; Canovas Nunes, S.; Arjomand, A.; Zaffino, F.; Manni, S.; Casellato, A.; Macaccaro, P.; Vitulo, N.; Zumerle, S.; Filhol, O.; Boldyreff, B.; Siebel, C. W.; Viola, A.; Valle, G.; Mainoldi, F.; Casola, S.; Cancila, V.; Gulino, A.; Tripodo, C.; Pizzi, M.; Dei Tos, A. P.; Trentin, L.; Semenzato, G.; Piazza, F.
Editorial: non-invasive testing for EoE-does microbiome testing hold the key? Authors' reply
2022 Facchin, S; Calgaro, M; Pandolfo, M; Caldart, F; Ghisa, M; Vitulo, N; Savarino, Ev
Salivary microbiota composition may discriminate between patients with eosinophilic oesophagitis (EoE) and non-EoE subjects
2022 Facchin, S; Calgaro, M; Pandolfo, M; Caldart, F; Ghisa, M; Greco, E; Sattin, E; Valle, G; Dellon, E; Vitulo, N; Savarino, Ev
Acclimation of photosynthesis and lipids biosynthesis to prolonged nitrogen and phosphorus limitation in Nannochloropsis gaditana
2021 Fattore, N.; Bellan, A.; Pedroletti, L.; Vitulo, N.; Morosinotto, T.
Natural contaminants in bee pollen: DNA metabarcoding as a tool to identify floral sources of pyrrolizidine alkaloids and fungal diversity
2021 De Jesus Inacio, Luciana; Merlanti, Roberta; Lucatello, Lorena; Bisutti, Vittoria; Carraro, Lisa; Larini, Ilaria; Vitulo, Nicola; Cardazzo, Barbara; Capolongo, Francesca
Assessment of statistical methods from single cell, bulk RNA-seq, and metagenomics applied to microbiome data
2020 Calgaro, Matteo; Romualdi, Chiara; Waldron, Levi; Risso, Davide; Vitulo, Nicola
Microbial metabarcoding highlights different bacterial and fungal populations in honey samples from local beekeepers and market in north-eastern Italy
2020 Balzan, S.; Carraro, L.; Merlanti, R.; Lucatello, L.; Capolongo, F.; Fontana, F.; Novelli, E.; Larini, I.; Vitulo, N.; Cardazzo, B.
A single polyploidization event at the origin of the tetraploid genome of Coffea arabica is responsible for the extremely low genetic variation in wild and cultivated germplasm
2020 Scalabrin, S.; Toniutti, L.; Di Gaspero, G.; Scaglione, D.; Magris, G.; Vidotto, M.; Pinosio, S.; Cattonaro, F.; Magni, F.; Jurman, I.; Cerutti, M.; Suggi Liverani, F.; Navarini, L.; Del Terra, L.; Pellegrino, G.; Ruosi, M. R.; Vitulo, N.; Valle, G.; Pallavicini, A.; Graziosi, G.; Klein, P. E.; Bentley, N.; Murray, S.; Solano, W.; Al Hakimi, A.; Schilling, T.; Montagnon, C.; Morgante, M.; Bertrand, B.
Engineering a 3D in vitro model of human skeletal muscle at the single fiber scale
2020 Urciuolo, Anna; Serena, Elena; Ghua, Rusha; Zatti, Susi; Giomo, Monica; Mattei, Nicolò; Vetralla, Massimo; Selmin, Giulia; Luni, Camilla; Vitulo, Nicola; Valle, Giorgio; Vitiello, Libero; Elvassore, Nicola
The mitochondrial genome assembly of fennel (Foeniculum vulgare) reveals two different atp6 gene sequences in cytoplasmic male sterile accessions
2020 Palumbo, F.; Vitulo, N.; Vannozzi, A.; Magon, G.; Barcaccia, G.
A multidisciplinary Approach to Evaluate Pyrrolizidine Alkaloids and their N_oxide Metabolites presence in Bee pollen: Conventional and Innovative methods
2019 Merlanti, Roberta; Lucatello, Lorena; DE JESUS INACIO, Luciana; Bisutti, Vittoria; Vitulo, Nicola; Larini, Ilaria; Cardazzo, Barbara; Capolongo, Francesca
First draft genome sequencing of fennel (Foeniculum vulgare Mill.): identification of simple sequence repeats and their application in marker-assisted breeding
2018 Palumbo, Fabio; Galla, Giulio; Vitulo, Nicola; Barcaccia, Gianni
Biocontrol traits of Bacillus licheniformis GL174, a culturable endophyte of Vitis vinifera cv. Glera 06 Biological Sciences 0604 Genetics 06 Biological Sciences 0607 Plant Biology 06 Biological Sciences 0605 Microbiology
2018 Nigris, Sebastiano; Baldan, Enrico; Tondello, Alessandra; Zanella, FILIPPO GIACOMO; Vitulo, Nicola; Favaro, Gabriella; Guidolin, Valerio; Bordin, Nicola; Telatin, Andrea; Barizza, Elisabetta; Marcato, Stefania; Zottini, Michela; Squartini, Andrea; Valle, Giorgio; Baldan, Barbara
Genomic analysis of Sparus aurata reveals the evolutionary dynamics of sex-biased genes in a sequential hermaphrodite fish
2018 Pauletto, Marianna; Tereza, Manousaki; Ferraresso, Serena; Babbucci, Massimiliano; Alexandros, Tsakogiannis; Bruno, Louro; Vitulo, Nicola; Viet Ha Quoc, ; Carraro, Roberta; Bertotto, Daniela; Franch, Rafaella; Maroso, Francesco; Aslam, Muhammad L.; Sonesson, Anna K.; Simionati, Barbara; Malacrida, Giorgio; Alessandro, Cestaro; Stefano, Caberlotto; Elena, Sarropoulou; Mylonas, Costantinos C.; Power, Deborah M.; Patarnello, Tomaso; Canario, Adelino V. M.; Costas, Tsigenopoulos; Bargelloni, Luca
The leaf transcriptome of fennel (Foeniculum vulgare Mill.) enables characterization of the t-anethole pathway and the discovery of microsatellites and single-nucleotide variants
2018 Palumbo, Fabio; Vannozzi, Alessandro; Vitulo, Nicola; Lucchin, Margherita; Barcaccia, Gianni
Transcriptional Characterization of a Widely-Used Grapevine Rootstock Genotype under Different Iron-Limited Conditions
2017 Vannozzi, A.; Donnini, S.; Vigani, G.; Corso, M.; Valle, G.; Vitulo, N.; Bonghi, C.; Zocchi, G.; Lucchin, M.
The accumulation of miRNAs differentially modulated by drought stress is affected by grafting in grapevine
2017 Pagliarani, C.; Vitali, M.; Ferrero, M.; Vitulo, N.; Incarbone, M.; Lovisolo, C.; Valle, G.; Schubert, A.
Transcriptome analysis of the regenerating tail vs. the scarring limb in lizard reveals pathways leading to successful vs. unsuccessful organ regeneration in amniotes
2017 Vitulo, Nicola; DALLA VALLE, Luisa; Skobo, Tatjana; Valle, Giorgio; Alibardi, Lorenzo
QueryOR: a comprehensive web platform for genetic variant analysis and prioritization
2017 Bertoldi, Loris; Forcato, Claudio; Vitulo, Nicola; Birolo, Giovanni; DE PASCALE, Fabio; Feltrin, Erika; Schiavon, Riccardo; Anglani, Franca; Negrisolo, Susanna; Zanetti, Alessandra; D'Avanzo, Francesca; Tomanin, Rosella; Faulkner, Georgine; Vezzi, Alessandro; Valle, Giorgio
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