BARGELLONI, LUCA
BARGELLONI, LUCA
Dipartimento di Biomedicina Comparata e Alimentazione - BCA
Integrated functional genomic analysis identifies regulatory variants underlying a major QTL for disease resistance in European sea bass
2025 Mukiibi, R.; Ferraresso, S.; Franch, R.; Peruzza, L.; Dalla Rovere, G.; Babbucci, M.; Bertotto, D.; Toffan, A.; Pascoli, F.; Faggion, S.; Peñaloza, C.; Tsigenopoulos, C. S.; Houston, R. D.; Bargelloni, L.; Robledo, D.
Machine Learning Methods for Phenotype Prediction from High-Dimensional, Low Population Aquaculture Data
2025 Faldani, Giovanni; Rossignolo, Enrico; Signor, Eleonora; Longo, Alessio; Faggion, Sara; Bargelloni, Luca; Comin, Matteo; Pizzi, Cinzia
Role of multi-omics in aquaculture genetics and breeding: current status and future perspective
2025 Yu, X.; Faggion, S.; Liu, Y.; Wang, B.; Zeng, Q.; Lu, C.; Hu, J.; Bargelloni, L.; Fang, L.; Bao, Z.
Temporal profiling of host transcriptome highlights time- and tissue-dependent Interferon pathway activation in NNV-infected European sea bass
2025 Peruzza, L.; Dalla Rovere, G.; Ferraresso, S.; Franch, R.; Bertotto, D.; Pascoli, F.; Bacchin, G.; Toffan, A.; Bargelloni, L.
Thermal priming mitigates the effects of lethal marine heatwaves on the Manila clam Ruditapes philippinarum
2025 Tucci, C. F.; Milan, M.; Dalla Rovere, G.; Bernardini, I.; Ferraresso, S.; Franch, R.; Babbucci, M.; Monticelli, G.; Panin, M.; Patarnello, T.; Bargelloni, L.; Peruzza, L.
Transcriptional modulation in Mediterranean Mussel Mytilus galloprovincialis following exposure to four pharmaceuticals widely distributed in coastal areas
2025 Bernardini, Ilaria; Mezzelani, Marica; Panni, Michela; Dalla Rovere, Giulia; Nardi, Alessandro; El Idrissi, Ouafa; Peruzza, Luca; Gorbi, Stefania; Ferraresso, Serena; Bargelloni, Luca; Patarnello, Tomaso; Regoli, Francesco; Milan, Massimo
Transcriptomic and microbiota responses in Mytilus galloprovincialis exposed to environmental concentrations of caffeine and cocaine
2025 Monticelli, G.; Nardi, A.; Mezzelani, M.; Bernardini, I.; Dalla Rovere, G.; El Idrissi, O.; Ferraresso, S.; Vivani, V.; Benedetti, M.; Gorbi, S.; Peruzza, L.; Bargelloni, L.; Patarnello, T.; Regoli, F.; Milan, M.
Advancing fish breeding in aquaculture through genome functional annotation
2024 Johnston, I. A.; Kent, M. P.; Boudinot, P.; Looseley, M.; Bargelloni, L.; Faggion, S.; Merino, G. A.; Ilsley, G. R.; Bobe, J.; Tsigenopoulos, C. S.; Robertson, J.; Harrison, P. W.; Martinez, P.; Robledo, D.; Macqueen, D. J.; Lien, S.
Population Genomics of the Blue Shark, Prionace glauca, Reveals Different Populations in the Mediterranean Sea and the Northeast Atlantic
2024 Leone, Agostino; Arnaud‐haond, Sophie; Babbucci, Massimiliano; Bargelloni, Luca; Coscia, Ilaria; Damalas, Dimitrios; Delord, Chrystelle; Franch, Rafaella; Garibaldi, Fulvio; Macias, David; Mariani, Stefano; Martinsohn, Jann; Megalofonou, Persefoni; Micarelli, Primo; Nikolic, Natacha; Prodöhl, Paulo ; Sperone, Emilio; Stagioni, Marco; Zanzi, Antonella; Cariani, Alessia; Tinti, Fausto
Preventing illegal seafood trade using machine-learning assisted microbiome analysis
2024 Peruzza, Luca; Cicala, Francesco; Milan, Massimo; Rovere, Giulia Dalla; Patarnello, Tomaso; Boffo, Luciano; Smits, Morgan; Iori, Silvia; De Bortoli, Angelo; Schiavon, Federica; Zentilin, Aurelio; Fariselli, Piero; Cardazzo, Barbara; Bargelloni, Luca
Spatio-temporal variations of growth, chemical composition, and gene expression in Mediterranean mussels (Mytilus galloprovincialis): A two-year study in the Venice lagoon under anthropogenic and climate changing scenarios
2024 Bordignon, F.; Bertolini, C.; Bernardini, I.; Dalla Rovere, G.; Iori, S.; Breggion, C.; Pastres, R.; Boffo, L.; Xiccato, G.; Matozzo, V.; Fabrello, J.; Asnicar, D.; Ciscato, M.; Masiero, L.; Marin, M. G.; Peruzza, L.; Bargelloni, L.; Patarnello, T.; Milan, M.; Trocino, A.
A Weight of Evidence approach to support the assessment of the quality of Manila clam farming sites in a coastal lagoon
2023 Cecchetto, M.; Giubilato, E.; Bernardini, I.; Bettiol, C.; Asnicar, D.; Bertolini, C.; Fabrello, J.; Bonetto, A.; Peruzza, L.; Ciscato, M.; Matozzo, V.; Marin, M. G.; Bargelloni, L.; Patarnello, T.; Marcomini, A.; Milan, M.; Semenzin, E.
An innovative index to incorporate transcriptomic data into weight of evidence approaches for environmental risk assessment
2023 Cecchetto, M.; Peruzza, L.; Giubilato, E.; Bernardini, I.; Dalla Rovere, G.; Marcomini, A.; Regoli, F.; Bargelloni, L.; Patarnello, T.; Semenzin, E.; Milan, M.
Contaminants from dredged sediments alter the transcriptome of Manila clam and induce shifts in microbiota composition
2023 Bernardini, I.; Quagliariello, A.; Peruzza, L.; Martino, M. E.; Dalla Rovere, G.; Iori, S.; Asnicar, D.; Ciscato, M.; Fabrello, J.; Corami, F.; Cecchetto, M.; Giubilato, E.; Carrer, C.; Bettiol, C.; Semenzin, E.; Marcomini, A.; Matozzo, V.; Bargelloni, L.; Milan, M.; Patarnello, T.
Evaluating Escherichia coli contamination in bivalve mollusks using the impedance method: a comparison with most probable number analyses and correlation with environmental parameters
2023 Currò, S.; Fasolato, L.; Balzan, S.; Biziato, G.; Paesanti, F.; Bargelloni, L.; Cardazzo, B.; Novelli, E.
Functional Evolution of Clustered Aquaporin Genes Reveals Insights into the Oceanic Success of Teleost Eggs
2023 Ferré, Alba; Chauvigné, François; Vlasova, Anna; Norberg, Birgitta; Bargelloni, Luca; Guigó, Roderic; Finn, Roderick Nigel; Cerdà, Joan
Impaired reproduction, energy reserves and dysbiosis: The overlooked consequences of heatwaves in a bivalve mollusc
2023 Peruzza, L.; Tucci, C. F.; Frizzo, R.; Riello, T.; Quagliariello, A.; Martino, M. E.; Manuzzi, A.; Dalla Rovere, G.; Bonsembiante, F.; Gelain, M. E.; Smits, M.; Borgheresi, O.; Camerani, F.; Panin, M.; Venier, P.; Mammi, S.; Hauton, C.; Patarnello, T.; Milan, M.; Bargelloni, L.
Integrating functional annotation data in genomic prediction models for viral nervous necrosis resistance in European sea bass.
2023 Faggion, S.; Mukiibi, R.; Bertotto, D.; Peruzza, L.; Babbucci, M.; Franch, R.; Dalla Rovere, G.; Ferraresso, S.; Peñaloza, C.; Houston, R.; Robledo, D.; Carnier, P.; Bargelloni, L.
Integrating functional annotation data in genomic prediction of VNN resistance in European sea bass.
2023 Faggion, S.; Mukiibi, R.; Bertotto, D.; Peruzza, L.; Babbucci, M.; Franch, R.; Dalla Rovere, G.; Ferraresso, S.; Peñaloza, C.; Houston, R.; Robledo, D.; Carnier, P.; Bargelloni, L.
Multi-omics for studying and understanding polar life
2023 Clark, M. S.; Hoffman, J. I.; Peck, L. S.; Bargelloni, L.; Gande, D.; Havermans, C.; Meyer, B.; Patarnello, T.; Phillips, T.; Stoof-Leichsenring, K. R.; Vendrami, D. L. J.; Beck, A.; Collins, G.; Friedrich, M. W.; Halanych, K. M.; Masello, J. F.; Nagel, R.; Norén, K.; Printzen, C.; Ruiz, M. B.; Wohlrab, S.; Becker, B.; Dumack, K.; Ghaderiardakani, F.; Glaser, K.; Heesch, S.; Held, C.; John, U.; Karsten, U.; Kempf, S.; Lucassen, M.; Paijmans, A.; Schimani, K.; Wallberg, A.; Wunder, L. C.; Mock, T.