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RepeatsDB in 2021: improved data and extended classification for protein tandem repeat structures
2021 Paladin, Lisanna; Bevilacqua, Martina; Errigo, Sara; Piovesan, Damiano; Mičetić, Ivan; Necci, Marco; Monzon, Alexander Miguel; Fabre, Maria Laura; Lopez, Jose Luis; Nilsson, Juliet F; Rios, Javier; Menna, Pablo Lorenzano; Cabrera, Maia; Buitron, Martin Gonzalez; Kulik, Mariane Gonçalves; Fernandez-Alberti, Sebastian; Fornasari, Maria Silvina; Parisi, Gustavo; Lagares, Antonio; Hirsh, Layla; Andrade-Navarro, Miguel A; Kajava, Andrey V; Tosatto, Silvio C E
Critical assessment of protein intrinsic disorder prediction
2021 Necci, M.; Piovesan, D.; Hoque, M. T.; Walsh, I.; Iqbal, S.; Vendruscolo, M.; Sormanni, P.; Wang, C.; Raimondi, D.; Sharma, R.; Zhou, Y.; Litfin, T.; Galzitskaya, O. V.; Lobanov, M. Y.; Vranken, W.; Wallner, B.; Mirabello, C.; Malhis, N.; Dosztanyi, Z.; Erdos, G.; Meszaros, B.; Gao, J.; Wang, K.; Hu, G.; Wu, Z.; Sharma, A.; Hanson, J.; Paliwal, K.; Callebaut, I.; Bitard-Feildel, T.; Orlando, G.; Peng, Z.; Xu, J.; Wang, S.; Jones, D. T.; Cozzetto, D.; Meng, F.; Yan, J.; Gsponer, J.; Cheng, J.; Wu, T.; Kurgan, L.; Promponas, V. J.; Tamana, S.; Marino-Buslje, C.; Martinez-Perez, E.; Chasapi, A.; Ouzounis, C.; Dunker, A. K.; Kajava, A. V.; Leclercq, J. Y.; Aykac-Fas, B.; Lambrughi, M.; Maiani, E.; Papaleo, E.; Chemes, L. B.; Alvarez, L.; Gonzalez-Foutel, N. S.; Iglesias, V.; Pujols, J.; Ventura, S.; Palopoli, N.; Benitez, G. I.; Parisi, G.; Bassot, C.; Elofsson, A.; Govindarajan, S.; Lamb, J.; Salvatore, M.; Hatos, A.; Monzon, A. M.; Bevilacqua, M.; Micetic, I.; Minervini, G.; Paladin, L.; Quaglia, F.; Leonardi, E.; Davey, N.; Horvath, T.; Kovacs, O. P.; Murvai, N.; Pancsa, R.; Schad, E.; Szabo, B.; Tantos, A.; Macedo-Ribeiro, S.; Manso, J. A.; Pereira, P. J. B.; Davidovic, R.; Veljkovic, N.; Hajdu-Soltesz, B.; Pajkos, M.; Szaniszlo, T.; Guharoy, M.; Lazar, T.; Macossay-Castillo, M.; Tompa, P.; Tosatto, S. C. E.
Assessing predictors for new post translational modification sites: A case study on hydroxylation
2020 Piovesan, D.; Hatos, A.; Minervini, G.; Quaglia, F.; Monzon, A. M.; Tosatto, S. C. E.
Exploring protein intrinsic disorder with mobidb
2020 Monzon, A. M.; Hatos, A.; Necci, M.; Piovesan, D.; Tosatto, S. C. E.
Experimentally determined long intrinsically disordered protein regions are now abundant in the protein data bank
2020 Monzon, A. M.; Necci, M.; Quaglia, F.; Walsh, I.; Zanotti, G.; Piovesan, D.; Tosatto, S. C. E.
Ensembles from Ordered and Disordered Proteins Reveal Similar Structural Constraints during Evolution
2019 Marchetti, Julia; Monzon, Alexander Miguel; Tosatto, Silvio C. E.; Parisi, Gustavo; Fornasari, María Silvina
Performance of computational methods for the evaluation of pericentriolar material 1 missense variants in CAGI-5
2019 Monzon, A. M.; Carraro, M.; Chiricosta, L.; Reggiani, F.; Han, J.; Ozturk, K.; Wang, Y.; Miller, HEATHER MARGARET LOUISE; Bromberg, Y.; Capriotti, E.; Savojardo, C.; Babbi, G.; Martelli, P. L.; Casadio, R.; Katsonis, P.; Lichtarge, O.; Carter, H.; Kousi, M.; Katsanis, N.; Andreoletti, G.; Moult, J.; Brenner, S. E.; Ferrari, C.; Leonardi, E.; Tosatto, S. C. E.
Assessment of patient clinical descriptions and pathogenic variants from gene panel sequences in the CAGI-5 intellectual disability challenge
2019 Carraro, M.; Monzon, A. M.; Chiricosta, Luigi; Reggiani, Francesco; Aspromonte, M. C.; Bellini, M.; Pagel, K.; Jiang, Y.; Radivojac, P.; Kundu, K.; Pal, L. R.; Yin, Y.; Limongelli, I.; Andreoletti, G.; Moult, J.; Wilson, S. J.; Katsonis, P.; Lichtarge, O.; Chen, J.; Wang, Y.; Hu, Z.; Brenner, S. E.; Ferrari, C.; Murgia, A.; Tosatto, S. C. E.; Leonardi, E.
DisProt: intrinsic protein disorder annotation in 2020
2019 Hatos, András; Hajdu-Soltész, Borbála; Monzon, Alexander M; Palopoli, Nicolas; Álvarez, Lucía; Aykac-Fas, Burcu; Bassot, Claudio; Benítez, Guillermo I; Bevilacqua, Martina; Chasapi, Anastasia; Chemes, Lucia; Davey, Norman E; Davidović, Radoslav; Dunker, A Keith; Elofsson, Arne; Gobeill, Julien; Foutel, Nicolás S González; Sudha, Govindarajan; Guharoy, Mainak; Horvath, Tamas; Iglesias, Valentin; Kajava, Andrey V; Kovacs, Orsolya P; Lamb, John; Lambrughi, Matteo; Lazar, Tamas; Leclercq, Jeremy Y; Leonardi, Emanuela; Macedo-Ribeiro, Sandra; Macossay-Castillo, Mauricio; Maiani, Emiliano; Manso, José A; Marino-Buslje, Cristina; Martínez-Pérez, Elizabeth; Mészáros, Bálint; Mičetić, Ivan; Minervini, Giovanni; Murvai, Nikoletta; Necci, Marco; Ouzounis, Christos A; Pajkos, Mátyás; Paladin, Lisanna; Pancsa, Rita; Papaleo, Elena; Parisi, Gustavo; Pasche, Emilie; Barbosa Pereira, Pedro J; Promponas, Vasilis J; Pujols, Jordi; Quaglia, Federica; Ruch, Patrick; Salvatore, Marco; Schad, Eva; Szabo, Beata; Szaniszló, Tamás; Tamana, Stella; Tantos, Agnes; Veljkovic, Nevena; Ventura, Salvador; Vranken, Wim; Dosztányi, Zsuzsanna; Tompa, Peter; Tosatto, Silvio C E; Piovesan, Damiano
MobiDB 3.0: More annotations for intrinsic disorder, conformational diversity and interactions in proteins
2018 Piovesan, Damiano; Tabaro, Francesco; Paladin, Lisanna; Necci, Marco; Micetic, Ivan; Camilloni, Carlo; Davey, Norman; Dosztányi, Zsuzsanna; Mészáros, Bálint; Monzon, Alexander M; Parisi, Gustavo; Schad, Eva; Sormanni, Pietro; Tompa, Peter; Vendruscolo, Michele; Vranken, Wim F; Tosatto, Silvio C. E.
Conformational diversity analysis reveals three functional mechanisms in proteins
2017 Monzon, Alexander Miguel; Zea, Diego Javier; Fornasari, María Silvina; Saldaño, Tadeo E.; Fernandez Alberti, Sebastian; Tosatto, Silvio; Parisi, Gustavo
Disorder transitions and conformational diversity cooperatively modulate biological function in proteins
2016 Zea, Diego Javier; Monzon, Alexander Miguel; Gonzalez, Claudia; Fornasari, María Silvina; Tosatto, Silvio; Parisi, Gustavo
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